Nature更正｜人类免疫健康图谱

摘要免疫的产生与维持是个依赖年龄的动态过程。为深入解析其变化规律本研究采用单细胞RNA测序、蛋白质组学与流式细胞术对300余名25–90岁健康成人的外周免疫进行解析并对96名成人开展为期2年的季节性流感疫苗接种纵向追踪。基于本研究构建的人类免疫健康图谱获得了包含1,600余万外周血单个核细胞、71个免疫细胞亚群的单细胞RNA测序数据集可系统解析免疫细胞组成与功能状态随年龄、慢性病毒感染及疫苗接种的变化规律。研究证实T细胞亚群随年龄发生显著的非线性转录重编程该过程不受全身炎症或慢性巨细胞病毒感染驱动这种年龄相关重编程使记忆T细胞呈现功能性2型辅助性T细胞TH2偏倚进而导致流感疫苗中高强化抗原诱导的B细胞应答紊乱。综上本研究揭示了高龄前免疫衰老的独特特征为年龄相关性免疫调控提供全新靶点。本研究同步提供交互式工具用于探索该大规模人类免疫健康资源。https://apps.allenimmunology.org/aifi/insights/dynamics-imm-health-age/peter.skenealleninstitute.orgclaire.gustafsonalleninstitute.org#多组学 #免疫衰老 #健康成人 #T细胞转录重编程 #TH2偏倚 #B细胞应答 #流感疫苗 #巨细胞病毒人类免疫的长期维持图1健康人免疫细胞转录组的年龄相关性改变随时间的维持a. Sound Life队列概况健康青年成人n49与老年前期成人n47采血节点包含流感疫苗接种时间序列与独立随访非常规时间点。b. 基线流感疫苗接种第1年第0天血浆蛋白质组中年龄相关蛋白表达差异的火山图采用线性模型经多重检验校正的双侧校正P值。c. 青年与老年前期成人血浆中CXCL17、WNT9A蛋白标准化表达量随时间的变化每名供体样本以连线连接灰色为线性回归线及95%置信区间标注斯皮尔曼秩相关系数与双侧P值右侧为年龄组分布。d. 1,370万外周血单个核细胞纵向免疫衰老数据集的均匀流形逼近与投影UMAPDC为树突状细胞。e. 流感疫苗接种第1年第0天青年与老年前期成人各免疫细胞亚群的差异表达基因数量热图展示性别、巨细胞病毒感染状态、流感疫苗接种/未接种组的差异基因对比。f. 流感疫苗接种第1年第0天青年与老年前期成人各细胞亚群频率变化及差异基因数量的气泡图气泡大小为频率差异与差异基因数的综合指标。g. 青年与老年前期成人中8个差异免疫细胞亚群的RNA年龄评分上调基因随时间的变化每名供体样本以细线连接灰色为线性回归线及95%置信区间标注相关系数与P值右侧为年龄组分布。全年龄段共性T细胞重编程图2全年龄段健康人免疫图谱的动态变化a. 高龄健康成人验证队列n23440岁至90岁以上的免疫解析概况。b. 健康衰老相关循环蛋白随年龄渐进性累积经典炎症因子TNF、IL-1β无年龄相关性IL-6、IL-11仅与高龄呈弱相关。c–d. 验证队列单细胞RNA测序数据证实经典免疫衰老特征核心初始CD8T细胞持续减少。e. CD27−效应B细胞年龄相关B细胞随年龄扩增。f. RNA年龄评分追踪显示8个衰老易感T细胞亚群的评分随年龄呈持续性非线性升高。g. 2个独立单细胞RNA测序数据集含1,000余名健康成人验证上述评分升高趋势。h. 各亚群RNA年龄评分共有基因鉴定26个基因随年龄下调、36个上调涵盖效应分化、胞内信号、细胞极化、凋亡相关基因。i. 人淋巴结多个T细胞亚群的RNA年龄评分随年龄升高提示T细胞重编程并非仅存在于外周血。j. 类风湿关节炎高危青年成人的CD4 中枢记忆T细胞RNA年龄评分显著高于同龄健康对照。本文初版中图2c和图2d存在多处标注错误。目前已在本文的HTML版和PDF版中完成修正详见下方图。原图与修正后的图2c、图2d巨细胞病毒感染与年龄的独立效应图3巨细胞病毒感染与年龄对外周免疫细胞图谱的影响a. 主队列与验证队列中巨细胞病毒阳性/阴性成人各细胞类型频率变化的气泡图气泡大小为双侧校正P值的负对数。b–c. 青年巨细胞病毒血清转化者随时间的T/NK细胞亚群分布以及巨细胞病毒阳性/阴性青年/老年前期成人的免疫细胞亚群分布。d. 青年与老年前期成人中巨细胞病毒感染相关扩增亚群的频率。e. 适应性NK细胞CD57KLRC2NK细胞的代表性流式图。f–g. 适应性NK细胞频率与KLRC2蛋白平均荧光强度随时间的变化。h. 热图展示巨细胞病毒阳性vs阴性组、巨细胞病毒阳性青年vs老年前期组的平均差异基因数量。i. 衰老易感T细胞亚群的RNA年龄评分按年龄与巨细胞病毒感染状态分层。年龄对疫苗诱导B细胞应答的影响图4 年龄相关的流感疫苗诱导B细胞应答a. 流感疫苗接种队列与研究设计概况。b. 2个流感季疫苗接种后第0天与第7天各流感毒株血凝抑制应答的弦图。c. B/Phuket毒株的血凝抑制应答组按年龄分布高、中、低应答分层。d. 青年与老年前期成人接种后第0、7、90天的血凝抑制平均抑制率。e. 疫苗接种前与接种后第7天记忆B细胞亚群的差异丰度分析UMAP。f. 接种后第7天青年与老年前期成人CD27−效应记忆B细胞的差异基因火山图。g–h. CD27−效应记忆B细胞中活化基因与免疫球蛋白基因的纵向表达。i. 接种后第7天青年与老年前期成人CD27−效应记忆B细胞上CD19、IgG蛋白表达的代表性流式图。j. 接种后第0、7、90天青年与老年前期成人血浆中B/Phuket特异性IgG水平。k. 接种后第7天青年与老年前期成人B/Phuket特异性IgG2/IgG3水平归一化至总特异性 IgG。l. 流感特异性应答与中枢记忆T细胞RNA年龄评分的斯皮尔曼相关性。炫张Nature主刊相关性热图年龄相关TH2偏倚与B细胞应答图5年龄相关记忆T细胞异常TH2样状态的累积a. 青年与老年前期成人CD4中枢记忆T细胞的TH1、TH2、TH17状态评分3角图。快来这口三角大锅里盛走你的小元宵b. 青年与老年前期成人CD4中枢记忆T细胞的TH1、TH2状态评分随时间的变化。c. 验证队列CD4中枢记忆T细胞的TH1、TH2、TH17状态评分3角图。快来这口三角大锅里盛走你的小元宵d. 3模态TEA-seq数据集的CD4T细胞RNA轨迹分析。e. 儿童与老年成人CD4T细胞中TH1/TH2相关转录因子基序可及性差异。f. CD4中枢记忆T细胞中IL4基因区域的染色质可及性轨迹。g. T细胞受体激活后青年与老年前期成人T细胞分泌的IL-4浓度。h. 流式细胞术检测记忆CD4T细胞的IL-4、IFNγ表达代表性图。i. 静息状态下青年与老年前期成人IFNγ−IL-4 记忆T细胞亚群频率热图。j. IFNγ−IL-4CD4中枢记忆T细胞频率与该亚群RNA年龄评分、IL-4分泌量、特异性IgG2水平的斯皮尔曼相关性。详细总结思维导图研究队列参考[0] Nature. 2025 Dec;648(8094):696-706. doi: 10.1038/s41586-025-09686-5.Multi-omic profiling reveals age-related immune dynamics in healthy adults251029imm-health-age.pdf[1] Nature. 2026 Apr 10. doi: 10.1038/s41586-026-10484-w.Author Correction: Multi-omic profiling reveals age-related immune dynamics in healthy adults260410correction.pdf注AI辅助创作如有错误欢迎指出。内容仅供参考不构成任何建议。